Havforskningsinstituttet (HI) har utviklet/tilpasset og tatt i bruk automatiserte metoder for DNA-ekstraksjon fra marine organismer. Måling av DNA-konsentrasjonen i etterkant er vesentlig, og denne prosessen skal automatiseres på samme robotplattform, for effektivisering av både tid og plass, samt bedre sikring av kvalitet og ergonomi.Havforskningsinstituttet har til hensikt å anskaffe Fluoreye On-Deck Fluorescence Detection System, levert av Hamilton.Hovedtrekkene i prosedyrenHavforskningsinstituttet (HI) har utviklet/tilpasset og tatt i bruk automatiserte metoder for DNA-ekstraksjon fra marine organismer på en Hamilton STAR robot. Automasjon gjør det mulig å hente ut DNA fra et stort antall prøver(tusenvis), for videre analyse med NGS (next generation sequencing). Måling av DNA-konsentrasjonen i etterkant av ekstraksjon er en vesentlig del av prøvebearbeidelsen i forkant av preparering av bibliotek for NGS. Denne prosessen med fluorescens-basert måling av DNA-konsentrasjon skal nå automatiseres på samme robotplattform som DNA-ekstraksjonen utføres. Dette gjøres både for effektivisering av tid og plass, men i tillegg vil dette gi bedre sikring av kvalitet ettersom prøvebrettene håndteres og flyttes mindre manuelt.Bare Fluroeye fra Hamilton kan integreres på robotens deck-layout med bruk av kun en SLAS/ANSI posisjon på dekk.Per i dag forsegles brettene med DNA-ekstrakt og oppbevares i forkant av manuell håndtering ved måling av DNA-konsentrasjon. Selve kjemien for reaksjonsløsningene i den manuelle metoden kan man velge å fortsette å benytte på den automatiserte metoden, ettersom systemet for dette er åpent. Dagens løsning er også en ergonomisk belastning på den som arbeider på laboratoriet, på grunn av mye pipettering.Havforskningsinstituttet har til hensikt å anskaffe Fluoreye On-Deck Fluorescence Detection System, levert av Hamilton, for å dekke nevnte behov for effektivisering, bedring i kvalitet og ergonomi.Kravene til Fluoreye-systemet:En Fluorescencedeteksjons modul for kvantifisering av DNA må kunne integreres på dekk på eksisterende system, et Hamilton ML STARØnsket Fluorescencedeteksjons modulen må ikke oppta mer enn en SLAS/ANSI posisjon på dekkInstrumentet som skal settes opp i roboten må kunne integreres sømløst med software på vår Hamilton STAR.Måling etter full kjøring med 4 plater skal ikke ta mer enn ca. 15 minutter.Dataoverføring må skje automatisk og trådløst.Kompatibilitet med ulike fluorescens-kit tilgjengelig på markedet
