Ved Molekylærbiologisk laboratorium skal vi gå til innkjøp av et neste-generasjon sekvenseringsinstrument (NGS). Vi ønsker et instrument med medium sekvenseringskapasitet, høy nøyaktighet, god brukervennlighet og god fleksibilitet.Hovedtrekkene i prosedyrenVed Molekylærbiologisk laboratorium skal vi gå til innkjøp av et neste-generasjon sekvenseringsinstrument (NGS). Vi ønsker et instrument med medium sekvenseringskapasitet, høy nøyaktighet, god brukervennlighet og god fleksibilitet.Instrument er primært tiltenkt brukt til populasjonsgenetiske analyser, hvor det skal erstatte SNP-analyser (Maldi-Tof) og mikrosatellittanalyse (kapillærelektorforese). I prioritert rekkefølge, planlegges disse bruksområdene for instrumentet som skal anskaffes: genotyping by sequencing (GBS, 1), artsidentifisering ved metabarcoding (2), CRISPR mutantsekvensering (3) til helgenom-resekvensering (4), og metyleringanalyse (5).Ved molekylærbiologisk laboratorium genotypes 25-30 000 prøver per år, og vår standard SNP-analyse inkluderer som vanlig 50 til 200 markører.På bakgrunn av tiltenkt bruk, ønsker vi et instrument som kan levere data med høy basenøyaktighet og med lav feilrate, leverer et høyt antall lesninger per kjøring og gi høy sekvenseringsdekning.